MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN07

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013737	ACCA	2	8	415	422	50 %	0 %	0 %	50 %	284005993
2	NC_013737	TC	3	6	463	468	0 %	50 %	0 %	50 %	284005993
3	NC_013737	CATC	2	8	622	629	25 %	25 %	0 %	50 %	284005993
4	NC_013737	AAGG	2	8	665	672	50 %	0 %	50 %	0 %	284005993
5	NC_013737	GGAG	2	8	727	734	25 %	0 %	75 %	0 %	284005993
6	NC_013737	AGG	2	6	805	810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005993
7	NC_013737	TC	3	6	816	821	0 %	50 %	0 %	50 %	284005993
8	NC_013737	CAA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005993
9	NC_013737	TGA	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005993
10	NC_013737	AG	3	6	1029	1034	50 %	0 %	50 %	0 %	284005993
11	NC_013737	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	284005993
12	NC_013737	GAC	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005993
13	NC_013737	C	6	6	1153	1158	0 %	0 %	0 %	100 %	284005993
14	NC_013737	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005993
15	NC_013737	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005994
16	NC_013737	GAA	2	6	1457	1462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005994
17	NC_013737	GCCA	2	8	1624	1631	25 %	0 %	25 %	50 %	284005994
18	NC_013737	TAA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005994
19	NC_013737	A	6	6	1680	1685	100 %	0 %	0 %	0 %	284005995
20	NC_013737	ATC	2	6	1771	1776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005995
21	NC_013737	AACC	2	8	1894	1901	50 %	0 %	0 %	50 %	284005996
22	NC_013737	AACC	2	8	1926	1933	50 %	0 %	0 %	50 %	284005996
23	NC_013737	AGA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005996
24	NC_013737	GAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005996
25	NC_013737	CAGC	2	8	2023	2030	25 %	0 %	25 %	50 %	284005996
26	NC_013737	TGACC	2	10	2063	2072	20 %	20 %	20 %	40 %	284005996
27	NC_013737	GA	3	6	2101	2106	50 %	0 %	50 %	0 %	284005996
28	NC_013737	TGA	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005996
29	NC_013737	AATT	2	8	2174	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	284005997
30	NC_013737	CCGA	2	8	2224	2231	25 %	0 %	25 %	50 %	284005997
31	NC_013737	TAA	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005998
32	NC_013737	A	6	6	2453	2458	100 %	0 %	0 %	0 %	284005998
33	NC_013737	ATC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
34	NC_013737	AAC	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005998
35	NC_013737	AAC	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005998
36	NC_013737	CTT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005998
37	NC_013737	ATC	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
38	NC_013737	ATC	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
39	NC_013737	TCG	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005998
40	NC_013737	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005999
41	NC_013737	TCG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005999
42	NC_013737	CGG	2	6	3660	3665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005999
43	NC_013737	CGCT	2	8	3671	3678	0 %	25 %	25 %	50 %	284005999
44	NC_013737	GTTGA	2	10	3680	3689	20 %	40 %	40 %	0 %	284005999
45	NC_013737	TACC	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	284005999
46	NC_013737	T	6	6	3745	3750	0 %	100 %	0 %	0 %	284005999
47	NC_013737	TGG	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005999
48	NC_013737	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005999
49	NC_013737	TGA	3	9	3879	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005999
50	NC_013737	CAG	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005999
51	NC_013737	GCG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005999
52	NC_013737	GCT	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005999
53	NC_013737	AAC	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006000
54	NC_013737	ATG	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006000
55	NC_013737	TGC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
56	NC_013737	TGG	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006000
57	NC_013737	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
58	NC_013737	GTT	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006000
59	NC_013737	GTC	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
60	NC_013737	GGATT	2	10	4435	4444	20 %	40 %	40 %	0 %	284006000
61	NC_013737	TGCT	2	8	4454	4461	0 %	50 %	25 %	25 %	284006000
62	NC_013737	ATC	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006000
63	NC_013737	TCA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006000
64	NC_013737	AGT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006000
65	NC_013737	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006001
66	NC_013737	ACC	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006001
67	NC_013737	CGG	3	9	4841	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006001
68	NC_013737	CTT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006001
69	NC_013737	CCT	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284006001
70	NC_013737	GGC	2	6	5061	5066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006001
71	NC_013737	GGT	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006001
72	NC_013737	GCT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006001
73	NC_013737	CTGCT	2	10	5257	5266	0 %	40 %	20 %	40 %	284006001
74	NC_013737	TGG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006002
75	NC_013737	CTT	2	6	5416	5421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006002
76	NC_013737	TGC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
77	NC_013737	TCG	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
78	NC_013737	GCC	2	6	5643	5648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006002
79	NC_013737	TCA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
80	NC_013737	GTG	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006002
81	NC_013737	TGGT	2	8	5838	5845	0 %	50 %	50 %	0 %	284006002
82	NC_013737	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006002
83	NC_013737	TTC	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006002
84	NC_013737	CTG	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
85	NC_013737	CG	3	6	6002	6007	0 %	0 %	50 %	50 %	284006002
86	NC_013737	ACT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
87	NC_013737	TCC	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284006002
88	NC_013737	TTG	2	6	6225	6230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006002
89	NC_013737	C	6	6	6347	6352	0 %	0 %	0 %	100 %	284006002
90	NC_013737	TCA	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
91	NC_013737	CGTC	2	8	6405	6412	0 %	25 %	25 %	50 %	284006003
92	NC_013737	CCA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006003
93	NC_013737	GCT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006003
94	NC_013737	ACT	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006003
95	NC_013737	CTG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006003

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.